Nazofaringeal sürüntü orofaringeal sürüntüye göre bazı avantajları vardır:

1. Nazofaringeal sürüntü daha fazla örnek elde etmek amacıyla farenkste uzun süre kalabilir, bu nedenle nazofaringeal sürüntüde pozitiflik oranı orofaringeal sürüntüye göre daha yüksektir.
2. Nazofarenjiyal sürüntü örnekleyicisinin maruz kalma riski, orofaringeal sürüntüye göre daha düşüktür, çünkü örnek alırken hastanın arkasında durabilir ve hastanın sadece burun deliklerini açığa çıkarmak ve ağzını kapatmak için maskeyi aşağı çekmesini isteyebiliriz ve hastanın ağız boşluğuna doğrudan bakmaya gerek yoktur. Ve Nazofarenjiyal sürüntüde neredeyse hiç faringeal refleks yoktur, birkaç hastada örnek aldıktan sonra hapşırma refleksi olabilir ve hasta dirsek veya kağıt havluyla örtülebilir ve çünkü örnekleyici doğrudan hastanın önünde değildir. Nazofarenjiyal sürüntünün maruz kalma riski nispeten daha düşüktür, bu da örnekleyicilerin psikolojik baskısını azaltır.

Nazofarenks sürüntüsünün dezavantajı ise oral ve faringeal sürüntü örneği alan hastaların psikolojik olarak daha fazla korku duymaları, örnek alanların ise daha fazla mesleki eğitim almış olmalarıdır.

Nazofaringeal sürüntü veya orofaringeal sürüntü toplamak olsun, toplama derinliği ve mukoza ile temas süresi önemli noktalardır . Nazofaringeal sürüntü nazofaringeal boşluğun derinliklerinde toplanmazsa, hasta orofaringeal sürüntüyü toplarken güçlü bir kusma reaksiyonu gösterir ve bu da yetersiz örnekleme süresine yol açar. Bu sırada toplanabilecek hücrelerin çoğu virüssüz hücrelerdir ve bu da "yanlış negatif"e neden olabilir. Bu ayrıca, negatif nükleik asit testi olan hastaların yeniden muayene sırasında tekrar nükleik asit pozitif görünmesinin nedenlerinden biri olabilir. Çin'de yapılan bir çalışmada, NPA ve OPS yöntemleri karşılaştırıldı, SARS, MERS ve H1N1 solunum örnekleme literatürleri incelendi ve tüm üst solunum yolu örnekleme yöntemleri arasında Nazofaringeal sürüntü ve orofaringeal sürüntünün (NS+OPS) tıbbi personel için en az zararlı olduğu sonucuna varıldı.